リフォームはされていますが、未登記であり築年数が不明な場合はどう対応すればよいでしょうか？

賃貸に出すにあたり未登記であることが客付けに影響することは殆どないと思いますので、あまり気にしなくて良いと思います。

建築年月が不明な点はマイナスになると思いますが、大規模修繕した日を伝えて、「●●年〇〇月にリフォーム済」ということをアピールできると良いと思います。