売主が建物登記をしていない理由は何かあるのでしょうか？

建物の登記がされない理由は色々とあり、費用が掛かる、建ぺいや容積をオーバーしてしまう、固定資産税が増加する場合があるなど様々です。また、10㎡以上の増築、準防火地域では㎡に拘わらず確認申請(建物を建築基準法に則って立ようとしている旨、申請すること。その後、検査があり問題なければ確認済証が発行されます)が必要で手間や費用が特に掛かるなどの不利益のため、登記されないことも多いと思います。