住宅ローンであっても金融機関に対して借入と返済実績があることはプラスに働きます。ただ、ここは金融機関に拠りますが、そこまで大きなインパクトがないことが多いと思います(小さい金融機関で住宅ローンと収益物件を扱う担当が一緒だったり何らか関係が近いと心象的にプラスになると思いますが、地銀レベルだとあまりないと思います)。
ついては、金利やその他の条件を優先して借入をして、その後不動産事業での融資開拓を進めていく中で、もし住宅ローンの借り換えもプラスになるという状況になれば取引してもらうためのカードとして借換を提示すると良いと思います。