基本的には問題ありません。
自主管理の場合でも、火災保険・家賃保証会社ともに、客付（入居者募集）を行った仲介会社の提案を利用するケースが一般的です。ただし、保証内容だけは事前に確認しておきましょう。
火災保険について
借家人賠償責任保険をかけ帯している火災保険であれば、客付を決めた仲介会社の提案する商品を利用しても問題ありません。代理店手数料が入りますから「こちらが要求する保証内容を満たしていれば顧客付を決めた仲介ものが扱っていますのでお願いしています」と伝えると、顧客付へのインセンティブになることもあります。
家賃保証会社について
保証会社も同様に客付仲介さんにお任せしても良いと思います。 なお、客付会社の提携している保証会社に加入する場合は、家賃保証に関しては、保証が家賃の数ヶ月分だけなど、保証が軽い場合もあるので十分な保証を受けてらるか確認してみましょう。
自主管理の場合は、Casaのオーナー向けサービスのように、オーナーが直接利用できる家賃保証サービスを活用しても良いと思います。