確認済証や検査済証を紛失してしまっている場合でも、役所の台帳に記録が残っている可能性があります。そのため、まずは売主さんに問い合わせてもらうのが良いと思います。
この書類がないことによる影響としては、主に金融機関からの融資がつかない可能性があることです。
また、受け継ぐべき書類としては、以下が重要と思います。
建築確認済証・検査済証
（上述の通り）その建物が法令を遵守して建てられた証拠です。これがないと住宅ローンの組換えなどが難しくなる場合があります。設計図書（図面一式）
平面図、立面図、構造図、配線図など。リフォームや修繕時に業者が参照します。地盤調査報告書
改良工事の有無や地盤の強さを確認できます。住宅性能評価書・耐震適合証明書
税制優遇（住宅ローン控除など）を受ける際に必要になることがあります。リフォーム履歴一式
過去の修繕内容や交換履歴が分かるため、今後の修繕計画にも役立ちます。