単身向けの部屋で決まらない時に2つの部屋の間の壁を取って一つの部屋にすることはそこそこ見かけます(要は単身だと決まらなくて苦しんだ証拠です。それで重要を確保できるようになり、収支が確保できるなら良い工事とも思っています)。
耐震性については物件1つ1つを見ないと何とも言えないところですが、壁を抜く際に屋根を支えている柱などは抜くことができないので、あまり耐震性に影響が出ることは少ないのではと思います。
抜いてしまった壁が建物全体の重さを支えているというケースは壁で強度を取る工法(ツーバイフォー)でなければあまりないと思います。