既存法人が所有する物件を、新設法人に貸して民泊運営することは問題ありませんか？

既存の法人で購入・賃貸に出している物件を、新設法人が借りて民泊運営を行うこと自体は、特に問題ないと考えられます。

ただし、賃料設定には注意が必要です。
相場から大きく乖離した金額で貸してしまうと、関連会社間での便宜供与（利益調整による税金逃れ）とみなされ、税務署から指摘を受ける可能性があります。

そのため、賃料に関しては説明できる金額で設定しましょう。（顧問税理士の先生に相談して決めると良いと思います。）