アパートと戸建てとで、デスクトップ調査の方法が異なるところはありますか。

アパートの場合も戸建てと考え方や調査方法は基本的には同じです。

違いがあるとすると、アパートの場合は間取りが複数ある場合は各間取りごとにターゲットや想定賃料などのヒアリングをする必要があるのと、戸建てよりも積算価格がどの程度かをより重要視することが多いかと思います。