間取りの変更や、単身向けの部屋で決まらない時に2つの部屋の間の壁を取って一つの部屋にするリフォームはそこそこ見かけます。（要は単身だと決まらなくて苦しんだ証拠で、それで需要を確保できるようになり、収支が確保できるなら良い工事とも思っています。）耐震性については物件1つ1つを見ないと何とも言えないところですが、壁を抜く際に屋根を支えている柱などは抜くことはできないので、あまり耐震性に影響が出ることは少ないのではと思います。抜いてしまった壁が建物全体の重さを支えているというケースは、壁で強度を取る工法(ツーバイフォー)でなければあまりないと思います。