ぶよぶよしている状態を詳細に確認しないと回答が難しいですが、
下記3つのパターンに分けられます。
①畳がぶよぶよなだけであれば畳の表替え
②表替えも難しいほど畳が壊れていたら畳の新調
③根太まで腐っていたら根太を交換し、畳を新調
③の場合は、畳ではなくCF貼りにした方がよいのでコストが許せば
コンパネを貼ってCF貼りにするという流れです。
①②は基本的に畳屋さんしかできず、
③を初心者がDIYするのはハードですが、Youtube等を確認してみて、
トライできそうであればやってみるのも良いと思います。