法人設立初期に空室期間も2～3か月を見込むと赤字になりそうで怖いのですが、対処方法はありますか？

戸建1件を購入して、空室期間が一定発生すると赤字になる可能性はあります。

1期目は物件取得費用などがかかり、赤字になることは一定の理解をしてくれる金融機関も多く、致し方ないかなと思います。最初は赤字決算でもそこから始めるしかない人もおり、早期に初めて改善できるように努めましょう。